Romuluson a Szenátusban heves viták tombolnak. A Romulus és testvérvilága, a Remus kettéváltak, de a remán vezető, Shinzon újra akarja egyesíteni őket. Shinzon tervét visszautasítják. Egy titokzatos szerkezet működésbe lép az egyik asztalon, és az egész termet különös, zöld energiával lepi el. Hirtelen fény tölti be a termet, és mindenkiben könyörtelen fájdalom ébred, amint a testük bomlásnak indul. Másodpercek alatt az egész Szenátus elpusztul. Ezalatt Jean-Luc Picard William Riker és Deanna Troi esküvő előtti ünnepségét vezeti le. A vőlegény tanújaként beszédet mond a körülötte történő változásról: Riker átveszi a Titan parancsnoklását és Troi is velemegy, így Data lesz az Enterprise első tisztje. Data mindenki meglepetésére szerenádot ad a párnak, elénekli a "Blue Skies" című dalt. Az ünnepség után az Enterprise a Betazed felé veszi az irányt; itt kerülne sor a hagyományos betazoid esküvőre. Útközben Worf egy pozitronikus jelet fog a Kolarus III nevű sivatagbolygóról. Mivel csak Dr. Soong androidjai küldhetnek ki ilyen jelet, az Enterprise a bolygó felé veszi az irányt.

Data, Picard és Worf leszállnak a bolygóra. Hamarosan különböző andorid testrészekre bukkanak, valamint egy fejre, amelynek arca megegyezik Data-éval. A missziót a Kolarus III lakosai zavarják meg, akik visszaüzik a csapatot a hajóra. A hajón Geordi felfedezi, hogy az andoridnak és Data-nak megegyezik a felépítése, de nem annyira fejlett. La Forge úgy véli, hogy ez egy prototípus. A fej B-4-ként mutatkozik be. Data segíteni szeretné B-4 fejlődését, ezért letölti a memóriáját B-4-es mátrixába. B-4 látszólag nem tudja az összes új információt feldolgozni, de La Forge emlékezteti Data-t, hogy ez neki is több időbe tellett. Később, Picard parancsot kap Janeway admirálistól egy romulusi akcióra. Az új prétor, Shinzon, Föderációs követet kér. A Romulusra tartó úton Data eligazítja a legénységet a remánokról, megemlítve, hogy a bolygójuk egyik oldalán lévő nagyon magas hőmérséklet miatt inkább a sötétebb oldalon élnek. A remánok harciasságukkal a Domínium-háborúból is kivették a részüket.

Az Enterprise-nak a kijelölt koordinátákon még 17 órát kell várnia, mielőtt megérkezne egy új, hatalmas űrhajó, a Scimitar. Shinzon helyettese megadja a transzport koordinátákat. A sötét belsejű hajóban a legénység találkozik Shinzonnal, aki egy ember. Shinzon érdeklődni kezd Troi iránt, mivel még sosem látott korábban emberi nőt. Picard tudni akarja, hogy mit akar az új prétor, de Shinzon csak annyit árul el, hogy a békéről és egységről vágyakozik. Amint Shinzon felkapcsolja a világítást, Picard megdöbben, hogy egy hozzá hasonló arcot lát. Shinzon elmondja, hogy a ritka Shalaft-szindrómában szenved, aztán elővesz egy kést, és megvágja magát, majd a kést Data-nak adja. Shinzon meghívja Picard egy vacsorára is.

Az Enterprise-on Dr. Crusher felfedezi, hogy Shinzon Picard klónja. A legénységt zavaraba ejti, hogy miért is létezhet ez a klón. Ezalatt a Romuluson Shinzon támogatói elégedetlenek: nem értik, hogy Picard és az Enterprise milyen szerepet játszik a tervben. Shinzon nyugalomra inti őket, és titokban felkéri Donatra-t, hogy figyelje a romulánok minden mozdulatát. Később, Shinzon a vacsora közben elmondja Picardnak, azért hozták létre, hogy kicseréljék vele, de a tervet felfüggesztették, mikor még Shinzon gyerek volt. A romulánok ezek után a Remus egyik dilítium bányájába küldték. Most Shinzon elmondása szerint csak békét akar remán testvéreinek. Picard nem bízik teljesen Shinzonban. Amint Picard elmegy, az alkirály figyelmezteti Shinzont, hogy ne felejtse el a küldetését.

Az Enterprise-on La Forge elmondja Picardnak, hogy valaki behatolt a főkomputerbe. La Forge az érzékelőnapló vizsgálata közben Geordi felfedezi, hogy amikor a Scimitar kilépett az álcából, thalaron nyomokat észleltek. A thalaron egy halálos sugárzás, mikroszkópikus mennyiség is elég minden élő anyag elpusztításához. Picard utasítja a legénységet, hogy találják meg e halálos fenyegetés ellenszerét. Aznap este a friss házasok, Troi és Riker már ágyban vannak, amikor Riker hirtelen eltűnik, és Shinzon és az alikrály beleférkőzik a tanácsadó agyába. Troinak sikerül kiűznie őket. A gyengélkedőn Troi igyekszik elmagyarázni az esetet Crushernek és Picardnak, amikor a kapitány is eltűnik, és a Scimitar fedélzetén találja megát. Shinzon B-4-et is a hajójára sugározta, arra használva az androidot, hogy rajta keresztül jusson hozzá Csillagflotta információkhoz. Amikor Shinzon mintát vesz Picard véréből, elmondja, hogy el akarja foglalni az egész Föderációt, hogy a remánok egyszer az egész Galaxison uralkodhassanak. Shinzon elmondja, hogy Picard már nem lesz életben, amikor ez megtörténik. Amikor Shinzon elmegy, B-4 visszatér, hogy elvigye a foglyokat. Amikor elindulnak kiderül, hoyg B-4 valójában Data, aki hamis információkkal látja el a remánokat. Az űrkomp dokkból ellopnak egy kis hajót, és a Scimitar folyosóin keresztül szöknek meg. Az Enterprise felszedi Picard-t és Data-t, és teret váltanak. Eközben a romulán Szenátusban nő az elégedetlenség - Shinzon még nem lépett semmit, mióta megszerezte a hatalmat. Shinzon újra türelmere int mindenkit. Donatrának és a többieknek azonban kétségeik támadnak, azt hiszik Shinzon terve túl sokáig elnyújtja a Föld legyőzését. Az Enterprise-on Dr. Crusher felfedezi, hogy Shinzonnak miért van szüksége Picard-ra. A hiányos klónozási eljárás miatt Shinzon sejtszerkezete leépülőben van. Ha nem kap transzfúziót Picardtól, meghal. Picard szerint Shinzon utánajön. Ezalatt Data deaktiválja B-4-et.

Később La Forge felfedezi a Scimitar thalaron-sugárzás fegyverét. A fegyver méretéből Picard kikövetkezteti a célpontot: a Föld. A legénység harcra készül Shinzon ellen. Data jelenti, hogy a hajó vak lesz, amíg át nem halad a Bassen hasadékon. Picard kitérő manővereket hajtat végre, de már későn - a Scimitar eltalálja az Enterprise és az kiesik a szubtérből. A harc közepén Shinzon találkozóra hívja Picard-t a kapitány szobájába. Picard a szobában Shinzon hologramját találja, aki megadásra szólítja fel. Picard igyekszik meggyőzni Shinzont, hogy lehet még jó ember is. Shinzon azonban nem harcolhat az ellen, ami. A csata hevéban az Enterprise váratlan segítséget kap két romulán harcimadár személyében, amelyeket Donatra irányít. Ekkor Troi elmondja: képes lehet megtalálni az álcázott Scimitart. Az alkirályon keresztüli mentális kapcsolat segítségével megtalálja a hajót, és az Enterprise-nak sikerül kilökni a Scimitart az álcából. A Scimitar visszalő, és az Enterprise pajzsai leválnak. Shinzon remánokat küld az Enterprise fedélzetére Picard-ért. Worf és Riker próbálja útjukat állni.

Ekkor már csak egy erőtér védi a híd legénységét az űrtől. Picard mindenáron meg akarja állítani a Scimitart, ezért az Enterprise minden energiáját felhasználva, nekirohan az ellenségnek. Ezalatt Riker megöli az alkirályt.

A thalaron fegyvert el kezdik beüzemelni, ezért Picard elszánja magát: átsugároz a Scimitarra. Ekkor Data Troinak adja a parancsnoklást, és az android kilöveti magát az űrbe a Scimitar felé. A remán hajó hídján Picard a legénység nagyrészét megöli, és halálos párbajba keveredik Shinzonnal. Végül Picard a hajó egy dárdaszerű részét használja arra, hogy megölje klónját. Shinzon utolsó szavaival még elmondja, hogy a végzete beteljesedett. Hirtelen Data is megjelenik, akinek sikerül kitranszportálnia a kapitányt a hajóról, és szétlőnie a thalaron fegyvert aktivációs mátrixát. Az Enterprise-ról a legénység még figyelemmel kísérheti, amint a Scimitar Data-val együtt elpusztul. Később, a főtisztek megemlékeznek elveszett társukról. Picard igyekszik elmondani a történteket B-4-nek, de az android úgy tűnik, még mindig nem érti a dolgokat. Amikor Picard már elmenne, B-4 el kezdni énekelni a "Blue Skies" című dalt, azt amit Data a szerenádon énekelt. Talán legalább Data memóriája továbbél.