Benjamin és Jennifer Sisko fia. 2355-ben születtett a Földön, édesanyját 2367-ben vesztette el Wolf 359-nél a borg támadás idején. 2369-ben érkezett a Deep Space Nine fedélzetére, amikor édesapja átvette az állomás parancsnokságát. Hamarosan összebarátkozott a ferengi Noggal, de barátságuknak sem apja, sem Nog nagybátyja, Quark nem örült. A két fiatal megalapította a Noh-Jay Konzorciumot, 2369-ben sikeres üzletet bonyolítottak le. 2371-ben Chief O'Brien segédje lett, apja azt remélte, Jake is a flotta tisztje lesz. A fiú azonban másként döntött; az írói pályát választotta. A klingonokkal folytatott háború idején, 2374-ben Bashir doktorrral a háborús övezetbe ment, hogy tudósítson az ott történtekről - a kirándulás majdnem az életébe került. Munkájának köszönhetően a Föderációs Híradó állandó munkatársa lett és amikor az állomást átadták a kardassziai-dominion flottának, Jake - apja tudta nélkül - az állomáson maradt, hogy tudósítson a fejleményekről. A háború idején segítette az ellnállás munkáját, Damar lecsukatta. Quark és Ziyal szabadította ki.