17. A '37-esek/The 37ers Miután a Voyager egy a Földről származó tárgyat talál, eljut egy feltérképezetlen bolygóra. Ott az atmoszferikus körülmények leszállásra kényszerítik őket, majd Janeway kapitány vezetésével egy régi földi repülő SOS jeleit követve rátalálnak egy kamrára, ahol kriogenikus egységek állnak. Az egyikben Amelia Earhartot, az első női pilótát találják, a másikban Tackleberryt, a Rendőrakadémiából.
18. Beavatás/Initiations Különleges vendégszereplő: Aron Eisenberg (Kar) - Nog, DS9. Amikor Chakotay kölcsönkér egy kompot, hogy megtarthassa a Pakrát, egy ősi indián rituálét, mellyel apja emléke előtt tiszteleg, a komp véletlenül becsúszik a Kazon Ogla területére, és Chakotay célpontjává válik egy ifjú kazonnak, aki csak úgy nyerheti el az Ogla harcos nevet, ha megöl egy ellenséget. 19. Kivetítés/Projections Rendezte: Jonathan Frakes. Vendégszereplő: Dwight Schultz (Barclay hadnagy, TNG). A Doktor hirtelen egyedül találja magát a hajón, és emberi életjeleket észlel magán. Lehet, hogy ő nem is hologram, hanem egy ember, akinek összezavarodott a valóságérzete egy holodecken ? - Igen, szerintem is zavaros.... 20. Átalakulás/Elogium Agresszív élőlények tapadnak a Voyager testére, egy elektroforetikus mezőt hozva létre ezzel. A jelenség hatására Kessel történik valami: belép az Elogiumba. Az Elogium az az egyetlen időszak egy ocampa életében, amikor gyermeke lehet. Neelix azonban még nem készült fel erre... 21. Kettészakadt idő/Non Sequitur Harry Kim zászlós zavarba jön, amikor felébred és otthon találja magát a Földön, a 24. századi San Franciscoban. Tervezőmérnökként dolgozik a Csillagflottánál, és hamarosan feleségül veszi Libbyt. Utánanéz a személyi aktájának, és meglepetésére azt találja, hogy soha sem volt a USS Voyager legénységének tagja. Pedig még nem járt le a szerződése a Paramounttal... 22. Kicsavarodva/Twisted A Voyager belefut egy tértorzulásba. A jelenség nemcsak a körülöttük levő teret, a hajót is "megcsavarja". A legénység kétségbeesetten küzd az ismeretlen jelenség hatása ellen   23. Zöldszemű szörnyeteg/Parturition Rendezte: Jonathan Frakes. Neelix féltékeny lesz Kesre, mert Parisszel tölti szabadidejét, és összeverekszik vele. Janeway, hogy kibékítse a két férfit, kettesben küldi őket egy küldetésre, de a kompjuk lezuhan egy M-osztályú bolygón. 24. Hallucinációk/Persistance of Vision Miközben a Voyager az első találkozásra készülődik a bothaniekkel, egy különös pszionikus mező hatására a legénység legmélyebb gondolatai kerülnek felszínre és jelennek meg. 25. Tetoválás/Tatoo Chakotay egy holdon kutat ásványok után, amikor összetalálkozik egy csoporttal, akik szemmel láthatóan indián eredetűek. Chakotay ősei nyelvén felveszi a kapcsolatot velük, s mindeközben arra kényszerül, hogy lezárja konfliktusát néhai apjával. Minden Chakotay-rajongó kedvenc része. 26. Hideg tűz/Cold Fire A Voyager egy űrállomáson ocampákat talál, akik végre elvezethetik őket a Gondviselő párjához, aki talán hazajuttathatja őket. Miközben a legénység nagy reményeket fűz a hazatérésről, az ocampák vezére felajánlja Kesnek, hogy maradjon az állomáson. 27. Cselszövések/Maneuvers Kazonok törnek be a hajóra és ellopnak egy transzporter vezérlő modult. Vezérük, Culluh megpróbálja rávenni a többi törzset, hogy egyesítsék erőiket a Voyager ellen. Nem magától ilyen okos - tanácsadója rendelkezik kardassziai, maquis és Csillagflottás taktikai tapasztalatokkal is: nem más, mint Seska, az áruló. Amikor Chakotay tudomást szerez volt társa terveiről, lelép a hajóról, hogy megállítsa, de fogságba esik. 28. Ellenállás/Resistance  A hajó rendszereihez szükséges tellerium keresése során Janeway, Tuvok, Torres és Neelix titokban lesugároz egy bolygóra, amit az ellenséges Mokra tart megszállva. Lebuknak, Tuvok és Torres fogságba esik, Janewayt pedig elrejti egy férfi, aki azt hiszi, hogy a kapitány az ő elveszett lánya. 29. Prototipus/Prototype Rendezte: Jonathan Frakes. A Voyager egy kikapcsolt robotot talál az űrben. B'Elanna Torres megjavítja a robotot, ami ezután azt követeli, hogy építsen egy prototípust, amely hozzá hasonló robotokat készít. Torres az Elsődleges Irányelv alapján megtagadja a kérést, de amikor megtalálják a robot hajóját, az elrabolja őt, és a Voyager elpusztításával fenyegetőzik. A föderációs hajó Idegen robotok háborújában találja magát. Aki ezek után meg szeretné nézni a részt, lelke rajta... 30. Szövetségesek/lliances A kazonok ismétlődő támadásai után Janeway úgy dönt: szemléletet változtat és egy szövetséges után néz. Először úgy gondolja, hogy az egyik kazon törzzsel kéne próbálkoznia, de aztán ráakad a Trabera, akiknek fő célja a békés egymás mellett élés másokkal. Szövetséget köt tehát - de az eredmények halálosak. 31.  A küszöb/Treshold  Paris történelmet ír, amikor sikerül elérnie egy komppal a 10. fokozatot. Csakhogy visszatérése után furcsa biokémiai változásokat tapasztal magán. A hét kérdése: kinek lesz Janeway az ex-felesége az epizód végére ? Senki nem fogja kitalálni... 32. Gyilkos gondolatok/Meld Különleges vendégszereplő: Brad Dourif (Suder). Gyilkosság történik a Voyageren. Tuvok nyomozása Suder zászlóshoz vezet, aki végül beismeri tettét. Mivel a vulkáni nem talál indítékot, úgy próbálja megérteni egy bűnöző kegyetlenségét, hogy tudategyesítést hajt végre Suderrel. 33. Csatahajó/Dreadnought Rendezte: LeVar Burton. A Voyager egy kardassziai tervezésű, önmagát vezérlő rakétát fedez fel, melynek robbanófejei jelentős pusztítást vihetnek véghez. Torresről kiderül, hogy még Maquis korában fogta el és programozta át a csatahajót, így most csak neki lehet esélye, hogy megállítsa. 34. Halálvágy/Death Wish Különleges vendégszereplők: John De Lancie (Q), Jonathan Frakes (Riker). Egy Q jelenik meg a Voyageren, és menedéket kér a hajón. Nem sokkal később megérkezik Q, aki vissza akarja vinni (az első) Q-t a Q Kontinuumba, arra a dimenziókon túli területre, ahol az ő halhatatlan fajuk él. A menekülő Q öngyilkosságot szeretne elkövetni, amit Q a Kontinuum érdekében nem engedhet. Janeway így hát a Csillagflotta szabályainak megfelelően meghallgatást tart a menedékjog ügyében. 35. Életjelek/Lifesigns A Voyager egy vészjelre válaszolva egy halálosan beteg viidiai nőt talál. A Doktor kezdi el kezelni, s átmenetileg egy holografikus testbe helyezi át a nő tudatát. Ahogy egyre több időt tölt az idegennel, a szintén orvos Denara Pellel, valami váratlan történik: alkalmazkodó programja lehetővé teszi, hogy a Doktor megtapasztalja a szerelmet. 36. A vizsgálat/Investigations Tom Paris, akivel az utóbbi időben sok probléma volt (már úgy értem, az átlagosnál is több - nem számítva a gyerekeket a kapitánytól), úgy dönt, elhagyja a Voyagert, hogy egy talaxiai konvoj pilótája legyen. Közben Neelix arra gyanakszik, hogy valaki a hajón kommunikál a kazonokkal, és újságírói kötelességének tartja (ő a "Jó reggelt, Voyager!" c. műsor házigazdája), hogy leleplezze az árulót. 37. Kettős csapda/Deadlock A Voyager, hogy elkerülje az üldöző viidiai hajókat, belép egy plazmafelhőbe. Mielőtt kiérnének, a hajó megremeg, a hajtómű leáll, és protontöltetek érik a gépházat. Janeway hamarosan felfedez egy másik Voyagert, hasonló legénységgel, egy párhuzamos univerzumban. A hajó valahogy megkettőződött, de nincs elég antianyag, hogy mindkettő megmaradjon. 38. Ártatlanság/Innocence Tuvok és Bennet kompja kényszerleszáll a Drayan bolygón. Hamarosan három kisgyerek bújik elő a vadonból, akik egy rejtelmes "morrok" jövetelét rettegik. Mialatt Tuvok a kétségbeesett triót nyugtatgatja, nem értve, hogy egy társadalom miért hagyja magára a gyermekeit, nem is sejti ennek a rejtélyes fajnak a titkát. Mi is megtudhatjuk, ha a végére nem alszunk el. 39. A félelem bére/The Thaw Különleges vendégszereplő: Michael McKean (a Bohóc). A Voyager érkezése aktivizál egy automatikus üzenetet a Kohl kolónián, melynek lakói egy környezeti katasztrófa után mesterséges hibernációba helyezték magukat, miközben tudatukat egy virtuális valóságot generáló számítógép felügyeli. A katasztrófa negatív hatásai már elmúltak, a legénység fel szeretné éleszteni a kolónia lakóit, ezért Torres és Kim rákapcsolják magukat a gépre, és belépnek annak mesterséges világába. Ekkor kezdődik a rémálom: a bennszülöttek legsúlyosabb félelmei a túléléssel kapcsolatban arra késztették a számítógépet, hogy megalkosson - félelmük idealizációjaként - egy szinte természetfeletti képességekkel rendelkező bohócot, aki túszul ejti Torrest és Kimet. 40. Tuvix/Tuvix Egy küldetésről visszatérve egy transzporter-balesetnek köszönhetően "összeolvad" Neelix és Tuvok. Az új lény, aki a Tuvix nevet választja, lassan beilleszkedik a társaságba. Némi időbe telik, amíg a Doktor kidolgoz egy módszert, amivel ketté lehet őket választani, de Tuvix nem akar meghalni... 41. Fertőzés/Resolutions Amikor egy küldetés során Janeway és Chakotay megfertőződik egy halálos vírussal, a legénység kénytelen hátrahagyni kapitányát és első tisztjét egy bolygón, melynek atmoszférája védelmet nyújt a betegség kialakulása ellen. 42. Életre-halálra 1 rész/Basics, Part 1 Különleges vendégszereplő: Brad Dourif (Suder). Chakotay üzenetet kap Seskától, hogy megszületett közös fiuk. Chakotay konfliktusba kerül önmagával, hogy megmentse-e a gyereket, mert Seska csak belemanipulálta ebbe az apaságba. Közben egy súlyosan sérült kazontól megtudják, hogy Culluh megölte Seskát, így a Voyager mentőakcióba indul. A sérült kazon azonban egy kamikaze, és mesterkedésének köszönhetően a hajó a kazonok kezére jut, akik kirakják a legénységet minden felszerelés nélkül egy idegen bolygón.